Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC103Q8IW40 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms