Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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