Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms