Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms