Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms