Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VIRMAQ69YN4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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