Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF220Q5VTB9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms