Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKDCCQ504Y2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms