Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC57Q2TAC2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC57Q2TAC2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms