Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IMPG1Q17R60 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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