Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CDO1Q16878 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDO1Q16878 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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