Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.284e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-231ENST00000502394 589 ntTSL 411.85□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-212ENST00000507860 571 ntTSL 47.86□□□□□ -1.153e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.193e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 CDC42-205ENST00000498236 816 ntTSL 57.49□□□□□ -1.214e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.214e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-218ENST00000511978 573 ntTSL 36.86□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-216ENST00000511249 447 ntTSL 46.15□□□□□ -1.423e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-209ENST00000504311 423 ntTSL 35.96□□□□□ -1.463e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 MATR3-214ENST00000509918 377 ntTSL 44.58□□□□□ -1.683e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.951e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-9■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.382e-9■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-9■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 DGUOK-203ENST00000418996 703 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.132e-9■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-10■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-10■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.173e-10■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-10■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-323■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-323■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-323■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 RBP4-204ENST00000629763 838 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.841e-323■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ING5-204ENST00000445620 662 ntTSL 36.18□□□□□ -1.422e-7■■■■□ 20.3
PCBP2Q15366 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.131e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.751e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 SSRP1-204ENST00000529002 648 ntTSL 517.56■□□□□ 0.41e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.351e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 AL390879.2-202ENST00000431464 646 ntTSL 216.77■□□□□ 0.281e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 SSRP1-202ENST00000293880 6296 ntTSL 215.96■□□□□ 0.151e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 SLC39A11-208ENST00000579988 910 ntTSL 315.92■□□□□ 0.141e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ZNF213-207ENST00000574928 5889 ntTSL 215.84■□□□□ 0.131e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.111e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ZNF213-209ENST00000576863 3245 ntTSL 215.32■□□□□ 0.041e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 DLK1-203ENST00000392848 555 ntTSL 414.77□□□□□ -0.051e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ATRX-215ENST00000624193 463 ntTSL 414.03□□□□□ -0.161e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.171e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.231e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ATRX-208ENST00000622960 628 ntTSL 512.19□□□□□ -0.461e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.491e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 AD000671.1-201ENST00000591613 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.531e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.581e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.711e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 SHANK2-206ENST00000424924 6821 ntTSL 510.51□□□□□ -0.737e-20■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 PSENEN-201ENST00000222266 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 HDLBP-208ENST00000422080 578 ntTSL 316.54■□□□□ 0.241e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 HDLBP-244ENST00000490697 581 ntTSL 416.54■□□□□ 0.241e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 HDLBP-223ENST00000449864 529 ntTSL 514.8□□□□□ -0.041e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 HDLBP-227ENST00000458564 420 ntTSL 39.52□□□□□ -0.891e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 HDLBP-213ENST00000427007 459 ntTSL 39.35□□□□□ -0.911e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 HDLBP-222ENST00000449504 566 ntTSL 56.81□□□□□ -1.321e-10■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.593e-8■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.471e-15■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-15■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.071e-15■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 NRBP1-206ENST00000460499 2561 ntTSL 213.18□□□□□ -0.31e-15■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-7■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 AP2A2-205ENST00000525796 551 ntTSL 519.1■□□□□ 0.653e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 AP2A2-218ENST00000529858 550 ntTSL 418.33■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 AP2A2-217ENST00000529818 549 ntTSL 49.45□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.022e-8■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 LARGE1-210ENST00000434071 562 ntTSL 416.4■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 LARGE1-213ENST00000494763 537 ntTSL 415.38■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 LARGE1-208ENST00000430220 559 ntTSL 415□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 LARGE1-204ENST00000413114 773 ntTSL 414.65□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 LARGE1-207ENST00000423375 568 ntTSL 49.38□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 LARGE1-209ENST00000432776 560 ntTSL 48.45□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.185e-11■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 BAX-210ENST00000513217 869 ntTSL 212.78□□□□□ -0.365e-11■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 CDC123-206ENST00000455773 959 ntTSL 516.67■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 CDC123-209ENST00000498747 890 ntTSL 311.81□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 CDC123-204ENST00000440613 685 ntTSL 510.02□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 CDC123-208ENST00000497963 963 ntTSL 25.71□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ACACA-245ENST00000619546 5315 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.044e-9■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.915e-11■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.355e-11■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ZNF318-202ENST00000605935 3836 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-7■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 ZNF318-203ENST00000606599 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 25.81□□□□□ -1.483e-7■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 USP32-208ENST00000589335 691 ntTSL 518.99■□□□□ 0.633e-7■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.423e-7■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 USP32-207ENST00000588898 578 ntTSL 511.92□□□□□ -0.53e-7■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 USP32-202ENST00000393003 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-7■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 210.11□□□□□ -0.793e-7■■■■□ 20.2
PCBP2Q15366 USP32-210ENST00000589761 430 ntTSL 29.83□□□□□ -0.843e-7■■■■□ 20.2
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