Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3GAP1Q15042 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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