Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms