Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXE3Q13461 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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