Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE3BQ13370 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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