Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL28Q13084 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL28Q13084 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL28Q13084 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL28Q13084 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL28Q13084 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL28Q13084 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPL28Q13084 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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MRPL28Q13084 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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MRPL28Q13084 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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MRPL28Q13084 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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MRPL28Q13084 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL28Q13084 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL28Q13084 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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