Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms