Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC1A2P43004 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A2P43004 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms