Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms