Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8BP10966 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8BP10966 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8BP10966 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms