Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRAP08240 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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