Protein–RNA interactions for Protein: P01213

PDYN, Proenkephalin-B, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDYNP01213 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDYNP01213 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDYNP01213 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDYNP01213 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDYNP01213 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDYNP01213 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDYNP01213 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDYNP01213 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDYNP01213 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDYNP01213 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDYNP01213 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDYNP01213 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDYNP01213 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDYNP01213 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDYNP01213 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms