Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms