Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLIN1O60240 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLIN1O60240 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms