Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SEPT9-224ENST00000589246 594 ntTSL 215.11■□□□□ 0.018e-10■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ATP11A-205ENST00000419448 435 ntTSL 37.61□□□□□ -1.194e-9■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.161e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 210.67□□□□□ -0.72e-7■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 PLXNB1-203ENST00000449094 3863 ntTSL 212.72□□□□□ -0.377e-7■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 LPIN3-202ENST00000445975 808 ntTSL 512.54□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 LPIN3-201ENST00000373257 4363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 LPIN3-205ENST00000632009 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 LPIN3-204ENST00000496565 568 ntTSL 39.5□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.077e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 C2orf82-208ENST00000481155 660 ntTSL 320.8■□□□□ 0.927e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 520.48■□□□□ 0.877e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.767e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 219.71■□□□□ 0.757e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SLC12A4-217ENST00000576462 673 ntTSL 218.87■□□□□ 0.613e-10■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-10■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 FADS2-211ENST00000522359 1654 ntTSL 416.27■□□□□ 0.197e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.177e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.867e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 LRRC59-202ENST00000503118 438 ntTSL 57.98□□□□□ -1.133e-10■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.257e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-7■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GAPDH-206ENST00000466525 1720 ntTSL 516■□□□□ 0.158e-7■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.328e-7■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GAPDH-207ENST00000466588 1363 ntTSL 510.79□□□□□ -0.688e-7■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 HGFAC-203ENST00000509689 1894 ntTSL 520.56■□□□□ 0.888e-14■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.678e-14■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.628e-14■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-7■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-7■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.335e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.095e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.671e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CRK-203ENST00000572145 830 ntTSL 39.43□□□□□ -0.91e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 STAU1-208ENST00000437404 1085 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.736e-12■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.486e-12■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.546e-12■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.636e-12■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.686e-12■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.736e-12■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.756e-12■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SLC2A4RG-207ENST00000493772 1328 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.613e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 28.61□□□□□ -1.039e-9■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 F7-205ENST00000479674 767 ntTSL 522.18■■□□□ 1.144e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.025e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.865e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.715e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.665e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.65e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)24.62■■□□□ 1.535e-6■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 RERE-208ENST00000465125 396 ntTSL 523.54■■□□□ 1.365e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 TRIP10-211ENST00000600491 1493 ntTSL 223.28■■□□□ 1.325e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-207ENST00000463086 505 ntTSL 522.53■■□□□ 1.25e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-209ENST00000480417 777 ntTSL 222.29■■□□□ 1.165e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-247ENST00000555733 924 ntTSL 522.15■■□□□ 1.145e-11■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 PACS2-209ENST00000549030 1925 ntTSL 220.7■□□□□ 0.915e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-212ENST00000485320 2357 ntTSL 520.67■□□□□ 0.95e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.795e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-209ENST00000476403 622 ntTSL 219.87■□□□□ 0.775e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.775e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ETV5-203ENST00000421809 554 ntTSL 219.76■□□□□ 0.755e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-208ENST00000478319 452 ntTSL 519.66■□□□□ 0.745e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.725e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.635e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.585e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 PACS2-212ENST00000551743 1876 ntTSL 518.5■□□□□ 0.555e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ETV5-210ENST00000476890 642 ntTSL 218.37■□□□□ 0.535e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.515e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-243ENST00000555384 775 ntTSL 518.1■□□□□ 0.495e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GRK6-204ENST00000502598 557 ntTSL 417.86■□□□□ 0.455e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.445e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-214ENST00000494611 474 ntTSL 517.8■□□□□ 0.445e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.435e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.45e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GRK6-208ENST00000511244 555 ntTSL 417.52■□□□□ 0.45e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.385e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.375e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.355e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-217ENST00000553567 555 ntTSL 417.08■□□□□ 0.325e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 PACS2-206ENST00000547903 1157 ntTSL 516.98■□□□□ 0.315e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GRK6-205ENST00000506296 955 ntTSL 516.84■□□□□ 0.295e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.235e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.235e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AC006001.3-202ENST00000639011 1819 ntTSL 516.44■□□□□ 0.222e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.25e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CXXC1-214ENST00000590901 2562 ntTSL 216.27■□□□□ 0.25e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-266ENST00000557198 583 ntTSL 216.24■□□□□ 0.195e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 FBRS-205ENST00000484152 510 ntTSL 316.18■□□□□ 0.185e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-220ENST00000553784 943 ntTSL 216.16■□□□□ 0.185e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.175e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.145e-6■□□□□ 10.8
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