Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF879B4DU55 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF879B4DU55 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF879B4DU55 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF879B4DU55 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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