Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFAF4Q9P032 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms