Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3AQ9NVI7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms