Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCC13Q9NSE7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms