Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NIT2Q9NQR4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms