Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR1EQ9GZS1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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