Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf27Q9GZN8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms