Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms