Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms