Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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