Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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