Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB2Q00722 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms