Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms