Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms