Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRISP1P54107 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms