Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CDKN1BP46527 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms