Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NTF3P20783 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms