Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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