Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX6A1P12074 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms