Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3P05106 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms