Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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LINC00587B1AMM8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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LINC00587B1AMM8 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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LINC00587B1AMM8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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LINC00587B1AMM8 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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LINC00587B1AMM8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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LINC00587B1AMM8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
LINC00587B1AMM8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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