Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX8Q9Y5X2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX8Q9Y5X2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms