Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSEQ9UL01 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms