Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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DUX4Q9UBX2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DUX4Q9UBX2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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